خبر فوریامروز

ویرایش اپی‌ژنوم با کریسپر بدون برش DNA و بازنشانی متیلاسیون

درمان قطعی بیماری‌های ژنتیکی بدون برش DNA؛ ویرایشگران اپی‌ژنتیک دوران کنونی با خاموش‌سازی دقیق نشانگرهای متیلاسیون، بافت‌های فرسوده را بازنشانی کردند.

ویرایش اپی‌ژنوم با کریسپر بدون
ویرایش اپی‌ژنوم با کریسپر بدون برش DNA و بازنشانی متیلاسیون — عکس: آرشیو ماگ بیت
خلاصه در یک نگاه
  • بررسی موشکافانه و تحلیلی جدیدترین دستاورد علم پزشکی و مهندسی زیستی امروزه با ظهور پلتفرم‌های ویرایش اپی‌ژنوم (CRISPR Epigenome Editing) مجهز به پروتئین‌های نارسای کاتالیتیک dCas9 و نانوذرات لیپیدی هدفمند (Targeted LNPs). تشریح چگونگی خاموش‌سازی پایدار ژن‌های جهش‌یافته بیماری‌زا و تنظیم مجدد متیلاسیون DNA بدون نیاز به شکستن فیزیکی رشته‌های کروموزوم؛ رفع کامل خطرات سرطان‌زایی ناشی از خطاهای دگرجا (Off-Target Cuts)، معکوس‌سازی سن بیولوژیکی بافت‌ها و درمان موفقیت‌آمیز اختلالات متابولیک ارثی و بیماری‌های قلبی-عروقی در کارآزمایی‌های بالینی اخیر.
  • بررسی جامع ابعاد فنی و کاربردی توسط تحریریه ماگ بیت.
  • پیش‌بینی اثرات کوتاه‌مدت و بلندمدت بر اکوسیستم فناوری.

پایان دوران خطرساز برش قیچی‌وار DNA؛ ظهور ویرایشگران بدون شکست دو رشته‌ای

از زمان ابداع سیستم کلاسیک CRISPR-Cas9 در سال ۲۰۱۲، این ابزار به عنوان قیچی مولکولی شناخته می‌شد که رشته‌های دورشته‌ای DNA را برش می‌زد تا سلول با سازوکارهای ترمیمی خود نقص ژنتیکی را اصلاح کند. با این حال، ایجاد شکست در هر دو رشته مارپیچ DNA (Double-Strand Breaks) همواره با خطری مرگبار همراه بود: احتمال جابجایی‌های کروموزومی ناخواسته، جهش‌های تصادفی در نقاط غیرهدف (Off-target mutations) و حتی فعال‌سازی مسیرهای سرطان‌زا مانند پروتئین p53.

امروزه جامعه پزشکی شاهد یک تغییر پارادایم بنیادین به سوی «ویرایش اپی‌ژنوم» بوده است. در این شیوه جدید، به جای آسیب زدن به خود متن ژنتیکی، علامت‌گذاری‌های شیمیایی اطراف DNA دستکاری می‌شوند؛ علامت‌هایی مانند گروه‌های متیل (Methylation) و استیل که مشخص می‌کنند یک ژن باید با چه شدتی خوانده شود یا به طور کامل به خواب برود.

این رصد اتمی و تصویربرداری دقیق مولکولی به لطف پیشرفت‌های شگرفی ممکن شده که در مقاله میکروسکوپی برودتی تک‌مولکولی Cryo-EM و دینامیک اتمی ۴ بعدی تشریح شد؛ جایی که دانشمندان توانستند دینامیک لحظه‌ای اتصال کمپلکس‌های پروتئینی به رشته‌های ژنوم را در وضوح زیر یک آنگستروم مشاهده و مهندسی نمایند.

معماری مولکولی سامانه‌های dCas9 و بازنویس‌های متیلاسیون اپی‌ژنتیک

سیستم‌های ویرایش اپی‌ژنوم دوران کنونی بر پایه نسخه‌ای غیرفعال‌شده از آنزیم برش‌زننده به نام 'Dead Cas9' یا dCas9 ساخته شده‌اند. این پروتئین اصلاح‌شده همچنان توانایی بی‌نظیر پیمایش و یافتن توالی هدف ۲۰ نوکلئوتیدی را دارد، اما تیغه‌های قیچی آن با جهش‌های نقطه‌ای از کار افتاده‌اند و کوچک‌ترین آسیبی به پیوند فسفودی‌استر اسکلت DNA وارد نمی‌کنند.

دانشمندان به این پروتئین راهنما، دامنه‌های عملکردی آنزیم‌های اپی‌ژنتیک متصل کرده‌اند؛ آنزیم‌هایی مانند DNA متیل‌ترانسفرازها (DNMT3A) برای خاموش کردن ژن‌ها یا د-متیلازها (TET1) برای بیدار کردن ژن‌های خاموش‌شده. زمانی که راهنمای RNA کمپلکس را به ناحیه پروموتر یک ژن مخرب هدایت می‌کند، این آنزیم‌ها گروه‌های متیل را روی سیتوزین‌ها می‌نشانند و ساختار کروماتین را متراکم می‌کنند.

شگفت‌آور اینکه این خاموشی اپی‌ژنتیک حتی پس از تقسیمات سلولی پی‌درپی پایدار باقی می‌ماند، بدون آنکه حتی یک حرف از رمز ۳ میلیارد حرفی ژنوم بیمار تغییر یافته باشد؛ دستاوردی که در تطابق با تکنیک‌های مدرن ذخیره‌سازی داده‌ها بر بستر DNA مصنوعی و آنزیم‌های بیوسنتتیک، توانایی بیولوژی مولکولی را در کنترل دقیق اطلاعات بیوشیمیایی نشان می‌دهد.

فرآیند پیوند مجتمع پروتئینی کریسپر اپی‌ژنتیک با زنجیره DNA و نشانه‌گذاری متیلاسیون
مکانیسم ویرایش اپی‌ژنوم: کمپلکس dCas9 بدون شکستن پیوند فسفودی‌استر اسکلت DNA، آنزیم‌های متیل‌ترانسفراز یا استیلاز را به پروموتر ژن هدف هدایت کرده و با رونویسی پایدار، ژن‌های مضر را برای تمام دوران حیات سلول خاموش می‌کند.

نانوذرات لیپیدی هدفمند (Targeted LNPs) و عبور از سدهای فیزیولوژیک بدن

تولید یک ویرایشگر ژنتیکی کارآمد تنها نیمی از نبرد است؛ نیمی دیگر، رساندن سالم این محموله بیولوژیک به سلول‌های بافت آسیب‌دیده بدون آسیب به کبد و سیستم ایمنی است. در نسل اول نانوذرات لیپیدی (LNP)، بیش از ۹۰ درصد نانوذرات بلافاصله توسط سلول‌های کبدی جذب می‌شدند و دسترسی به مغز، قلب و ریه ناممکن بود.

در آزمایش‌های بالینی دوران کنونی نانوذرات لیپیدی پپتیدی هدفمند به کار گرفته شده‌اند که سطح آن‌ها با آنتی‌بادی‌های نانومتری و لیگاند‌های گیرنده‌ویژه تزئین شده است. این نانوذرات مانند بسته‌های پستی هوشمند، بار mRNA کدکننده dCas9 را مستقیماً به بافت عضلانی قلب یا نورون‌های حرکتی تحویل می‌دهند.

این فرآیند هدف‌گیری دقیق شباهت چشمگیری با رویکردهای نوین میکروربات‌های زیست‌هیبریدی شناگر در دارورسانی هدفمند دارد که با عبور از سد خونی-مغزی، درمان اختلالات سیستم عصبی مرکزی را به واقعیت بدل کرده‌اند.

پیروزی‌های درخشان در کارآزمایی‌های بالینی؛ بازنشانی سن بیولوژیکی و درمان کلسترول ارثی

نتایج فاز دوم کارآزمایی‌های بالینی منتشر شده در اکتبر نشان داد که یک بار تزریق وریدی داروی اپی‌ژنتیک توانسته ژن PCSK9 را در کبد بیماران مبتلا به هایپرکلسترولمی خانوادگی برای همیشه خاموش کند و میزان کلسترول بد خون را تا ۷۰ درصد بدون نیاز به مصرف مادام‌العمر استاتین‌ها کاهش دهد.

فراتر از درمان بیماری‌ها، ویرایش اپی‌ژنوم قدرتمندترین ابزار برای معکوس کردن ساعت پیری سلولی (Epigenetic Clock) محسوب می‌شود. در سلول‌های فرسوده، الگوهای متیلاسیون در طول دهه‌ها زندگی آشفته شده و منجر به التهاب مزمن و کاهش عملکرد بافت‌ها می‌گردد. با بازتنظیم موقت و هدفمند نشانگرهای اپی‌ژنتیک، محققان موفق شده‌اند بدون بازگرداندن سلول به حالت بنیادی پرخطر، کارایی میتوکندری و انعطاف‌پذیری عروق خونی را به وضعیت ۲۰ سال جوان‌تر بازگردانند.

علم ژنتیک امروزه از مرحله 'اصلاح حروف اشتباه' عبور کرده و به مرحله 'تنظیم ارکستر بیان ژن‌ها' رسیده است؛ مسیری درخشان که امید به درمان بیماری‌های لاعلاج خودایمنی، آلزایمر و سرطان را بیش از هر زمان دیگری در تاریخ زنده کرده است.

⚠️ سلب مسئولیت پزشکی

اطلاعات و داده‌های ارائه‌شده در این مقاله صرفاً با هدف افزایش آگاهی در زمینه فناوری‌های سلامت منتشر شده است و نباید به عنوان توصیه، تشخیص یا پروتکل درمانی پزشکی تلقی گردد. پیش از هرگونه تصمیم‌گیری یا تغییر در برنامه‌های سلامت فردی، با پزشک متخصص مشورت نمایید.

این مطلب را با دوستانتان به اشتراک بگذارید
م
نوشته‌ی
منا پدرام

روزنامه‌نگار حوزه‌ی علم و فضا؛ علاقه‌مند به روایت آدم‌ها و تغییراتی که فناوری در زندگی روزمره ایجاد می‌کند.

همه‌ی مطالب
مطالب پیشنهادی ماگ بیت

بیشتر از علم و فضا

مشاهده همه